Die SDF Macross ist das letzte Rettungsschiff der Menschheit auf dem Weg nach Hause. Während eines Angriffs der Zentraedi trifft der Pilot Ichijo Hikaru auf die Sängerin Lynn Minmay. Doch es wäre nicht Macross, wenn da nicht noch eine Dritte im Bunde wäre. Es ist Hayase Misa, sie schließt das Dreieck, das die Hauptgeschichte in diesem Movie ist. Der Film ist eine überarbeitete Zusammenfassung der Serie mit einigen neuen Storyelementen.